新生兒各臟器功能發育尚未成熟，身體免疫功能比較差，因此發病率高，如能仔細觀察還是可以發現問題的。新生兒疾病大概會有下列三種情況：
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新生兒的各種疾病，最常出現的是 “三不”：
但有的新生兒得病後並沒有出現“三不”，相反卻表現為煩躁不安，多哭多鬧，不肯入睡。感染性疾病在其他年齡階段常表現為發燒，可是新生兒感染時不一定都發燒，體溫可以正常，病情重時還可以體溫不高，甚至全身冰冷。
例如呼吸系統疾病時有鼻塞和咳嗽，新生兒鼻塞影響呼吸和吸乳，因此吃奶時常哭鬧不安。新生兒患肺炎時出現呼吸急促或口吐白沫。消化系統疾病時出現嘔吐、腹瀉、腹脹或便秘。中樞神經系統疾病時（如化膿性腦膜炎）出現眼睛定視和各部位肌肉的抽動等。
正常新生兒的皮膚嬌嫩，呈淺紅色，嘴唇呈深紅色。
患病時可能出現：
1、黃疸，雖然正常新生兒在生後3-10天可以出現生理性黃疸，但這種黃疸色不深，也不影響小兒食慾和精神狀態，如果黃疸比較深，或突然加重，或超過出生後10天仍持續不退，就可能是疾病的表現，需要就診。
2、粘膜（如口唇）、唇周或指甲呈青灰色，常由於動脈血氧濃度低或由於休克血流緩慢引起，多見於敗血症和硬腫症等嚴重疾病，常伴有精神萎靡、食慾差等症狀。單純粘膜和皮膚青紫多為青紫型先天性心臟病。
3、某些病毒感染性疾病時皮膚可出現麻疹樣皮疹，分佈在前胸、腹部、背部和臉部。
4、嚴重敗血症或出血性疾病時四肢、胸頸部或其他部位皮膚可出現深紅色出血點或紫紅色瘀斑。
5、皮膚和粘膜蒼白表示貧血，多由溶血或出血性疾病引起。此外皮膚和皮下組織水腫或硬腫也是疾病的表現。
各種先天性畸形和遺傳性疾病雖然出生時已經存在，但不是都在新生兒期發病，例如先天性心臟病種類很多，但在新生兒期發病的主要是大血管錯位、左心發育不良、肺靜脈回流異常等複雜的畸形。消化道畸形在新生兒期發病的較多，如食道梗阻、幽門肥大、小腸發育不食品店、無肛等，這些疾病都有各系統的特殊症狀，不難被家長發現。